A héttagú nemzetközi zsűri a legjobb rendezőnek járó Ezüst Medvét az Egyesült Államokban született, de Izraelben élő Joseph Cedarnak ítélte Beaufort című filmjéért. A libanoni-izraeli határon játszódó film a Beafort támaszponton szolgálatot teljesítő izraeli katonákról szól, akik miután 2000-ben elhagyják a támaszpontot, végignézik, hogy néhány órával később miként robbantják fel azt a libanoni erők.
A legjobb férfi főszereplőnek járó Ezüst Medvét az argentin Julio Chávez az El Otro (A másik) főszereplője kapta, míg a legjobb női alakításért járó Ezüst Medve díjazottja a Yella című német film főszereplője, Nina Hoss lett.
Bogdán Árpád Boldog új élet című filmje - amely a 38. Magyar Filmszemlén elnyerte a legjobb elsőfilmes díját - elismerő oklevelet kapott a berlini fesztiválon. Az úgynevezett Shooting Stars programban Nagy Péter, Herendi Gábor Lora című filmjének férfi főszereplője részesült kitüntetésben. Az immár 57-ik berlini filmfesztiválon egyébként felettébb sokszínű volt a magyar jelenlét. A különböző programokban öt magyar rövidfilm és egy játékfilm volt látható.
A fesztivál versenyprogramjában szerepelt Szilágyi Varga Zoltán Jegyzőkönyv - Mansfeld Péter emlékére című animációs filmetűdje. Ugyancsak a Panoráma szekcióban került bemutatásra Esztergályos Károly Férfiakt című alkotása.
2006 legnézettebb magyar mozifilmje, a Goda Krisztina által rendezett Szabadság, Szerelem a Berlinale Special válogatásba kapott meghívást.
A Berlinalén tartották a magyar Filmszemle legjobb játékfilmjének díjával kitüntetett Bollók Csaba Iszka utazása című alkotásának nemzetközi premierjét is. A Kárpátok bányavidékein, viszontagságos körülmények között élő gyerekek, köztük a címszereplő Iszka mindennapjait bemutató film a Berlinale Generation elnevezésű versenyprogramjában nagy elismerést aratott.
